大腸桿菌表達(dá)系統(tǒng)
簡(jiǎn)介
將目的基因片段插入特定載體后導(dǎo)入宿主細(xì)胞大腸桿菌中誘導(dǎo)其大量表達(dá)蛋白質(zhì)的方法。
原理
原核表達(dá)質(zhì)粒載體的構(gòu)建→轉(zhuǎn)化到高效表達(dá)的宿主菌→目的蛋白的誘導(dǎo)表達(dá)→細(xì)菌的擴(kuò)大培養(yǎng)→制備細(xì)菌蛋白粗提物→目的蛋白質(zhì)的純化。
設(shè)計(jì)含有 His 標(biāo)簽的目的基因引物,通過(guò)克隆手段構(gòu)建能在大腸桿菌中表達(dá)的重組基因質(zhì)粒載體,隨后將質(zhì)粒轉(zhuǎn)化入大腸桿菌中,通過(guò) IPTG 誘導(dǎo),大腸桿菌會(huì)高表達(dá)目的蛋白,將大腸桿菌破碎后,目的蛋白溶解于上清中,Ni 柱中的氯化鎳或者硫酸鎳可以與有 His(組蛋白)標(biāo)簽的堿性蛋白蛋白結(jié)合。
在蛋白上柱后,帶有組氨酸標(biāo)簽的蛋白特異性結(jié)合到柱子里,其他的雜蛋白流出。Ni 柱中的氯化鎳或者硫酸鎳可以也可以與咪唑結(jié)合,咪唑與 His 標(biāo)簽競(jìng)爭(zhēng)性結(jié)合在 Ni 柱上,因此我們利用低濃咪唑洗脫雜蛋白,利用高濃度咪唑梯度洗脫目的蛋白,收集洗脫液,最后通過(guò)透析去除咪唑就能獲得目的蛋白。
用途
可用于體外大量純化目的蛋白,做 pull-down 實(shí)驗(yàn)、純化蛋白產(chǎn)物等等。
材料與儀器
1、誘導(dǎo)表達(dá)材料
(1)LB(Luria—Bertani)固體培養(yǎng)基
酵母膏(Yeast extract)5 g
蛋白胨(Peptone)10 g
NaCl 10 g
瓊脂(Agar)1~2%
蒸餾水(Distilledwater)1 000 ml pH 7.0
(2)LB(Luria—Bertani)液體培養(yǎng)基
酵母膏(Yeast extract)5 g
蛋白胨(Peptone)10 g
NaCl 10 g
蒸餾水(Distilledwater)1 000 ml pH 7.0
(3)IPTG 貯備液:
2 g IPTG 溶于 10 mL 蒸餾水中,
0.22 μm 濾膜過(guò)濾除菌,分裝成 1 mL/份,-20 ℃ 保存。
2、大腸桿菌破碎材料——超聲破碎法
(1)超聲緩沖液:
20 mM Tris-HCL(PH 根據(jù)目的蛋白情況決定,一般避開(kāi)蛋白的等電點(diǎn),約為 7 左右);
400 mM NaCl(鹽濃度也依據(jù)蛋白的性質(zhì)決定,鹽濃度越高越不易沉淀形成包涵體);
(2)清洗緩沖液:超聲緩沖液中+30 mM 咪唑;
(3)洗脫緩沖液:超聲緩沖液中+100 mM、200 mM、300 mM、400 mM、500 mM 咪唑。
步驟
1、外源基因的誘導(dǎo)表達(dá)
(1)設(shè)計(jì)含有 His 標(biāo)簽的目的基因引物。
(2)構(gòu)建目的蛋白與 His 標(biāo)簽的融合基因,連接于大腸桿菌表達(dá)質(zhì)粒當(dāng)中。
(2)將構(gòu)建好的質(zhì)粒轉(zhuǎn)化到相應(yīng)的大腸桿菌表達(dá)系統(tǒng)的宿主菌(如 BL21),涂于液體 LB 培養(yǎng)基上,37 ℃ 過(guò)夜培養(yǎng)。
(3)挑取單菌落,接種于 50 ml 液體 LB 培養(yǎng)基,過(guò)夜培養(yǎng)。
(4)擴(kuò)大培養(yǎng),依據(jù) 1:100 的接種量,將菌液接種至大型 LB 液體培養(yǎng)基當(dāng)中,37 ℃ 培養(yǎng)。
(5)培養(yǎng)條件:根據(jù)不同啟動(dòng)子及菌種類型調(diào)整蛋白誘導(dǎo)的條件。例如,在 BL21 中表達(dá) T7 啟動(dòng)子的工程菌,菌液渾濁后測(cè)量培養(yǎng)液的 OD600 達(dá) 0.4~0.6,迅速使溫度降至 16 ℃ 進(jìn)行 IPTG 誘導(dǎo),誘導(dǎo)濃度為 11 mmol/L,誘導(dǎo)后繼續(xù)培養(yǎng) 12 h,進(jìn)行收菌,裂解。
2、大腸桿菌分離與蛋白質(zhì)純化
1)細(xì)菌的裂解
常用方法有:① 高溫珠磨法;② 高壓勻漿;③ 超聲破碎法;④ 酶溶法;⑤ 化學(xué)滲透等。后三種方法在實(shí)驗(yàn)室研究中應(yīng)用較為廣泛,下面主要介紹超聲破碎法的實(shí)驗(yàn)步驟。
超聲破碎法:聲頻為 15~20 kHz 的超聲波在高強(qiáng)度聲能輸入下可以進(jìn)行細(xì)胞破碎,在處理少量樣品時(shí)操作簡(jiǎn)便,液體量損失較少,同時(shí)還可對(duì)染色體 DNA 進(jìn)行剪切,大大降低液體的粘稠度。
① 收集 1 L 誘導(dǎo)表達(dá)的工程菌,4 ℃,5 000 rpm 離心,15 min;棄上清,約每克濕菌加 3 ml 超聲緩沖液。
② 按超聲處理儀廠家提供的功能參數(shù)進(jìn)行破菌(如超聲 4 s,停頓 6 s,功率 40%);10 000 g 離心,15 min,分別收集上清液和沉淀。
2)鎳柱純化
① 將上清收集過(guò) Ni 柱,二次流穿,收集流穿后的上清。
② 用體積約 100 ml 的清洗緩沖液清洗鎳柱
③ 根據(jù)實(shí)驗(yàn)?zāi)康氖褂孟鄳?yīng)體積的洗脫緩沖溶液,根據(jù)咪唑的梯度洗脫目的蛋白,收集不同咪唑濃度洗脫下的蛋白。此步驟如果再預(yù)裝柱及蠕動(dòng)泵中可自動(dòng)化,無(wú)需配置梯度溶液。
④ 可以選用適宜孔徑大小的濃縮柱將蛋白濃縮。
⑤ 分別取各個(gè)步驟的留樣及最后的洗脫下的目的蛋白,加入等體積的 2×凝膠電泳加樣緩沖液,進(jìn)行 SDS-PAGE 跑膠,隨后考馬斯亮藍(lán)染色檢測(cè)是否純化到目的蛋白。
注意事項(xiàng)
(1)超聲破碎與聲頻、聲能、處理時(shí)間、細(xì)胞濃度、菌種類型等因素有關(guān),應(yīng)根據(jù)具體情況掌握;超聲波破菌前,標(biāo)本經(jīng) 3~4 次凍溶后更容易破碎。
(2)盡量每個(gè)步驟的上清與沉淀都收集起來(lái),最后用 SDS-PAGE 檢測(cè)樣品,能判斷出那個(gè)步驟實(shí)驗(yàn)有誤。
(3)根據(jù)不同啟動(dòng)子及菌種類型調(diào)整蛋白誘導(dǎo)的條件。如果表達(dá)載體的原核啟動(dòng)子為 PL 啟動(dòng)子,則在 30~32 ℃ 培養(yǎng)數(shù)小時(shí),使培養(yǎng)液的 OD600 達(dá) 0.4~0.6,迅速使溫度升至 42 ℃ 繼續(xù)培養(yǎng) 3~5 h;如果表達(dá)載體的原核啟動(dòng)子為 tac 等,則 37 ℃ 培養(yǎng)細(xì)菌數(shù)小時(shí)達(dá)到對(duì)數(shù)生長(zhǎng)期后加 IPTG 至終濃度為 1 mmol/L。繼續(xù)培養(yǎng) 3~5 h。
(4)純化蛋白應(yīng)根據(jù)蛋白特性的不同更改純化調(diào)節(jié),例如應(yīng)盡量避開(kāi)蛋白等電點(diǎn),避免蛋白的沉淀;例如某些蛋白容易降解所以應(yīng)在低溫環(huán)境下操作,避免蛋白過(guò)快降解;某些蛋白表達(dá)較低,可提高 IPTG 工作濃度或增加誘導(dǎo)時(shí)間。
常見(jiàn)問(wèn)題
蛋白質(zhì)在細(xì)菌中的高水平表達(dá),常形成相差顯微鏡下可見(jiàn)到的細(xì)胞質(zhì)顆粒,即為包涵體,經(jīng)離心沉淀后可用 Triton-X100/EDTA 或尿素洗滌,若為獲取可溶性的活性蛋白,須將洗滌過(guò)的包涵體重新溶解并進(jìn)行重折疊。洗滌液 I 配方如下:
0.5% TritonX-100
10 mmol/L EDTA(pH8.0)
(1)細(xì)胞裂解混合物 12 000 g 離心,15 min,4 ℃;棄上清,沉淀用 9×洗滌液 l 懸浮;室溫放置 5 min;12 000 g 離心 15 min,4 ℃;吸出上清,用 100 μl 水重新懸浮沉淀;分別取 10 μl 上清和重新懸浮的沉淀,加 10 μl 2×凝膠電泳加樣緩沖液,進(jìn)行 SDS-PAGE。
(2)包涵體的溶解和復(fù)性
① 緩沖液 I:
1 mmol/L PMSF
8 mol/L 尿素
10 mmol/L DTT
溶于前述裂解緩沖液中。
② 緩沖液Ⅱ:
50 mmol/L KH2PO4
1 mmol/L EDTA(pH8.0)
50 mmol/L NaCI
2 mmol/L 還原型谷胱甘肽
1 mmol/L 氧化型谷胱甘肽
③ KOH 和 HCI。
(2)用 100 μl 緩沖液 I 溶解包涵體;室溫放置 l h;加 9×緩沖液Ⅱ,室溫放置 30 min,用 KOH 調(diào) pH 到 10.7;用 HCI 調(diào)至 pH 8.0,在室溫放置至少 30 min; 1 000 g 離心,15 min,室溫;吸出上清液并保留,用 100 μl 2×凝膠電泳加樣緩沖液溶解沉淀;取 10 μl 上清,加 10 μl 2×凝膠電泳加樣緩沖液,與 20 μl 重新溶解的沉淀進(jìn)行 SDS-PAGE。