真核轉錄組測序
主要針對轉錄產物mRNA進行高通量測序,可快速獲得某一物種特定組織或器官在某一狀態下的基因表達量及結構變異等,可用于差異表達分析、挖掘功能基因、RNA編輯分析等。目前已廣泛應用于生物學研究、農業、醫學等多個領域,揭示生物生長發育調控機制、不同環境適應機制、作物優良形成機理、疾病發生發展的分子機理等。
應用領域:
樣本全轉錄本信息獲取、基因注釋及篩選、基因結構分析
產品優勢:
1、準確的數字化信號,專業的檢測通量,廣泛的檢測范圍
2、富涵7大功能注釋數據庫,準確描述基因功能
3、建立差異表達分析,有效挖掘功能基因
4、專業的定制化信息分析服務
標準信息分析
1、測序數據及其質量控制
2、轉錄組測序數據組裝
3、轉錄組文庫質量評估
4、Unigene功能注釋
5、基因結構分析:CDS預測、SSR分析、SNP分析
6、基因表達量分析:Unigene表達量計算、不同樣品總體表達量比對
7、差異表達分析: 重復相關性評估、差異表達基因篩選、差異表達基因聚類分析
8、差異表達基因功能注釋和富集分析:差異表達基因GO功能富集、差異表達基因COG分類、差異表達基因KEGG注釋、差異表達基因KEGG通路富集分析
樣品要求:
1.樣品類型:總RNA;
2.樣品濃度:≥250 ng/ul;
3.樣品總量:>6ug(真核生物);>10ug(原核生物)
4.樣品純度: OD260/280為1.8~2.2,OD260/230≥1.0,260nm處有正常峰值。
5.RNA完整性: 電泳檢測28S/18S≥1.5。(距送樣日最近的電泳結果)