lncRNA測序
長鏈非編碼RNA(LncRNA)是一類長度大于200nt且不編碼蛋白質的RNA,通常伴隨著mRNA協同轉錄,廣泛存在于各種生物體內,在表觀遺傳、轉錄及轉錄后等水平調控基因表達,在生命活動中具有重要作用。LncRNA測序是研究已有參考基因組物種的特定組織或細胞在某個特定時期轉錄出的所有LncRNA和mRNA。
應用領域:
新lncRNA找尋與預測、疾病研究、調控網絡研究。
產品優勢:
1、分析內容多方面: 不限于對已知lncRNA的研究分析,并設置嚴格的篩選條件預測新的lncRNA;
2、數據信息量大:可一次性獲得樣本中幾乎所有的lncRNA信息,有利于提高后續分析結果的準確性和多方面性;
3、測序物種多元:對包括人類、動植物在內的許多物種的lncRNA進行鑒定和分析;
4、關聯多方面分析:得到mRNA數據,可開展lncRNA與mRNA的關聯分析,深入分析lncRNA調控網絡。
標準信息分析
mRNA分析 | SNP、Indel鑒定、可變剪切鑒定、基因結構優化、預測新轉錄本、差異mRNA聚類、差異表達分析、差異基因功能注釋通路富集分析等 |
lncRNA分析 | 差異lncRNA篩選、lncRNA注釋、lncRNA保守性分析 、lncRNA定量及差異表達分析、lncRNA家族分析、靶基因預測、miRNA前體預測分析等 |
lncRNA-mRNA 關聯分析 | 表達水平分析、差異表達分析、共表達網絡構建分析、Cis/Trans作用分析等 |
樣品要求:
1、樣品類型:總RNA;
2、樣品濃度:≥200 ng/ul;
3、樣品總量:≥10ug;
4、樣品純度:OD260/280為1.8~2.2,OD260/230≥1.0,260nm處有正常峰值;無基因組DNA污染;
5、RNA完整性:電泳檢測28S/18S≥1.5。(據送樣日最近的電泳結果)