PCR技術:Taq DNA聚合酶屬性
重組DNA技術工具酶
Taq DNA聚合酶 是從一種水生棲熱菌(Thermusaquaticus)yT1株分離提取的.yT是 一種嗜熱真菌,能在70~75℃生長.該菌是1969年從美國黃石國家森林公園火山溫泉 中分離的.
(一)酶活性與熱穩定性
該酶基因全長2496個堿基,編碼832個氨基酸,酶蛋白分子為 94KDa.其比活性為200000單位/mg.75~80℃時每個酶分子每秒鐘可延伸約150個核苷 酸,70℃延伸率大于60個核苷酸/秒,55℃時為24個核苷酸/秒.溫度過高(90℃以上) 或過低(22℃)都可影響Taq DNA聚合酶的活性,該酶雖然在90℃以上幾乎無DNA合成, 但確有良好的熱穩定性,在PCR 循環的高溫條件下仍能保持較高的活性.在92.5℃、95℃ 、97.5℃時,PCR混合物中的Taq DNA聚合酶分別經130min,40min和5~6min后,仍可 保持50%的活性,實驗表明.PCR反應時變性溫度為95℃~20sec,50個循環后,Taq DNA聚合酶仍有65%的活性.Taq DNA聚合酶的熱穩定性是該酶用于PCR反應的前提條 件,也是PCR反應能迅速發展和廣泛應用的原因.Taq DNA聚合酶還具有逆轉錄活性, 其作用于類似逆轉錄酶.此活性溫度一般為65~68℃,有Mn2+存在時,其逆轉錄活性 更高.
(二)離子依賴性
aqDNA聚合酶是Mg2+依賴性酶,該酶的催化活性對Mg2+濃度非常敏感.以活性程度 很低的鮭魚精子DNA為模板,dNTP的濃度為0.7~0.8mmol/L時,用不同濃度Mg2+進行 PCR 反應10min,測定結果為Mgcl2濃度在2.0mmol/L時該酶催化活性最高,此濃度能最 大限度地激活TaqDNA聚合酶的活性,Mg2+過高就抑制酶活性,當Mgcl2濃度在 10mmol/L時可抑制40~50%的酶活性.由于Mg2+能與dNTP結合而影響PCR反應液中游離 的Mg2+濃度,因而Mgcl2的濃度在不同的反應體系中應適當調整,優化濃度.一般反應 中Mg2+濃度至少應比dNTP總濃度高0.5~1.0mmol/L.適當濃度的KCL能使Taq DNA聚合 酶的催化活性提高50~60%,其最適濃度為50mmol/L,高于75mmol/L時明顯抑制該酶 的活性.
(三)忠實性
TaqDNA聚合酶具有5"→3"聚合酶活性和5"→3"外切酶活性,而無3"→5"外切活 性,它不具有Klenow酶的3"→5"校對活性.因而,在PCR 反應中如發生某些堿基的錯 配,該酶是沒有校正功能的.Taq DNA聚合酶的堿基錯配機率為2.1×10-4.
(四)抑制劑
低濃度的尿素、甲酰胺、二甲基甲酰胺(DMF)和二甲基亞砜(DMSO )對Taq DNA聚合酶的 催化活性并無影響.極低濃度的離子表面活性劑如脫氧膽胺酸鈉(小于0.06%),十二烷 基肌氨酸鈉(小于0.02%),十二烷基硫酸鈉(SDS,小于0.01%)幾乎可完全抑制該酶的 活性.而非離子表面活性劑在較高濃度(Tween20,NP-40.和Tritox-100)如>5%時方能 抑制該酶的活性.
變性劑對TaqDNA聚合酶活性的影響
變性劑 | 濃度 | 活性(%) |
乙醇 | ≤3% | 100 |
10% | 110 | |
尿素 | ≤0.5mol/L | 100 |
1.0mol/L | 118 | |
1.5mol/L | 107 | |
2.0mol/L | 82 | |
DMSO | ≤1% | 100 |
10% | 53 | |
20% | 11 | |
DMF | ≤5% | 100 |
10% | 82 | |
20% | 17 | |
甲酰胺 | ≤1% | 100 |
15% | 86 | |
20% | 39 | |
SDS | 0.001% | 105 |
0.01% | 10 | |
0.1% | 〈0.1 |
低濃度的NP-40(0.05%)和Tween20(0.05%)能增強TaqDNA聚合酶的活性.低濃度SDS對 該酶的抑制作用可加入一定濃度的NP-40和Tween20抵消.TaqDNA聚合酶可在-20℃貯 存至少6個月.
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