活的諾如病毒在水微觀世界中的持久性
人類諾如病毒是全球急性胃腸炎的主要原因之一。由于人類諾如病毒在實驗室中基本上無法培養,目前評估諾如病毒環境歸宿的方法依賴于使用可培養的替代病毒和分子方法。這些方法本質上是保守的,因為它們能檢測到沒有傳染性的受損病毒顆粒。而人腸道類腸桿菌(HIE)是一種新興的細胞培養系統,能夠擴增活的諾如病毒,Marlee Shaffer等人首次利用HIE測定來評估活的諾如病毒和諾如病毒 RNA 在表面、水龍頭和去離子水微觀世界中的持久性,與傳統分子方法進行比較。發現分子方法進行的當前環境諾如病毒檢測與通過 HIE 測定評估的活力之間存在脫節,分子監測并不代表傳染性諾如病毒。
材料和方法
所有水樣(超純水、自來水和地表水)均在圣母大學采集。超純水和自來水均從相關實驗室用水系統中無菌取樣。HIEs 來源于 Lgr5+ 成體腸道干細胞。分別用GII.4 Sydney[P31] 陽性糞便濾液感染水樣和3天后分化好的HIE細胞。實驗共進行28天。其中衰變率k:。Nt 是時間 t 的基因組拷貝,N0 是時間 0 的基因組拷貝,k 是衰減率,t 是時間(以分鐘為單位)。
結果:如圖1顯示,HIE檢測在28天內,擴增的諾如病毒 RNA 信號持續下降,活的諾如病毒在自來水和去離子水微觀世界中降至檢測限以下。而在實驗期間,通過 RT-qPCR 測量的 RNA 未觀察到明顯的 RNA 衰變。
通過 HIE 測定對于地表水、自來水和超純水活諾如病毒的推定衰變率分別為 0.11 ± 0.02 天 - 1、0.08 ± 0.02 天 - 1、0.10 ± 0.01 天 - 1 ,不同水類型的 k 值之間沒有顯著差異。
參考文獻:Shaffer M, Huynh K, Costantini V, Bibby K, Vinjé J. Viable Norovirus Persistence in Water Microcosms. Environ Sci Technol Lett. 2022;9(10):851-855. doi:10.1021/acs.estlett.2c00553
來源:微生物安全與健康網,作者~徐穎歡。