遺傳密碼的特點
1 ）每個密碼子三聯體 (triplet) 決定一種氨基酸；
2) 兩種密碼子之間無任何核苷酸或其它成分加以分離，即密碼子無逗號 ;
3) 密碼子具有方向性，例如 AUC 是 Ile 的密碼子， A 為 5' 端堿基， C 為 3' 端堿基。
因此密碼也具有方向性，即 mRNA 從 5' 端到 3' 端的核苷酸排列順序就決定了多肽鏈中從 N 端到 C 端的氨基酸排列順序 ;
4) 密碼子有簡并性 (degeneracy) 一種氨基酸有幾個密碼子，或者幾個密碼子代表一種氨基酸的現象稱為密碼子的簡并性。除了 Met 和 Trp 只有一個密碼子外，其它氨基酸均有二個以上密碼子，例如 Arg 有 6 個密碼子。
5) 共有 64 個密碼子，其中 AUG 不僅是 Met 或者 fMet( 在原核細胞 ) 的密碼子，也是肽鏈合成的起始信號，故稱 AUG 為起始密碼子。 UAA 、 UAG 和 UGA 為終止密碼子，不代表任何氨基酸，也稱為無意義密碼子。
6) 密碼子有通用性，即不論是病毒、原核生物還是真核生物密碼子的含義都是相同的。
但真核細胞線粒體 mRNA 中的密碼子與胞漿中 mRNA 的密碼子有以下三點不同 : 一是線粒體中 UGA 不代表終止密碼子，而是編碼 Trp; 二是肽鏈內的 Mer 由 AUG 和 AUA 二個密碼子編碼，起始部位的 Met 由 AUG 、 AUA 、 AUU 和 AGG 均為密碼 ; 三是 AGA 和 AGG 不是 Arg 的密碼子，而是終止密碼子，即 UAA 、 UAG 、 AGA 和 AGG 均為終止密碼子。
密碼子結構與氨基酸側鏈極性之間有一定關系 .
1) 氨基酸側鏈極性性質在多數情況下由密碼子的第二個堿基決定。第二個堿基為嘧啶 (Y) 時，氨基酸側鏈為非極性，第二個堿基為嘌呤 (P) 時，氨基酸側鏈側有極性 .
2) 當第一個堿基為 U 或 A ，第二個堿基為 C ，第三個堿基無特異性時，所決定的氨基酸側鏈為極性不帶電 ;
3) 當第一個堿基不是 U ，第二個堿基是 G 時，氨基酸側鏈則帶電。在此前提下，若第一個是 C 或 A 時，表示帶正電的氨基酸 ; 第一、第二個堿基分別是 G 、 A 時，此種氨基酸帶負電。但上述關系也有個別例外。
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